Pri čistení flexotlačového stroja je potrebné pri výbere typu čistiacej kvapaliny zvážiť dva aspekty: jedným je, že by mala zodpovedať typu použitého atramentu;druhá je, že nemôže spôsobiť opuch alebo koróziu tlačovej dosky.Pred tlačou je potrebné tlačovú platňu vyčistiť čistiacim roztokom, aby bol povrch tlačovej platne čistý a bez nečistôt.Po vypnutí je potrebné tlačovú platňu ihneď vyčistiť, aby sa zabránilo zaschnutiu a stuhnutiu vytlačeného atramentu na povrchu tlačovej platne.